آیت الله لطیفی پس از گذراندن دوران سطح طلبگی، به قم عزیمت کرد و شاگرد آیت الله بروجردی و سپس شاگرد درس امام خمینی شد. همچنین او چهار سال شاگرد درس فلسفه و عرفان علامه طباطبایی بود.