هرچند مدارک موجود و نظر سازمان بازرسی کل کشور گواه این است که زمین مدرسه اتمی مشهد، متعلق به آموزش و پرورش خراسان رضوی است، اما دستیار ویژه رئیس سازمان انرژی اتمی معتقد است، این زمین متعلق به آموزش و پرورش نیست.
مدیرکل اسبق آموزش و پرورش خراسان رضوی گفت : احداث مدرسه انرژی اتمی مشهد یکی از افتخارات دوران مدیریت من است و اتهامهای وارده در این زمینه را با افتخار قبول میکنم.