استفاده از آنتیبیوتیکها، داروهای ضداسهال، داروهای بیولوژیک، کورتیکواستروئیدها و داروهای سرکوب و تعدیلکننده سیستم ایمنی بدن، به بهبود بیماری التهابی روده کمک میکند. مصرف غذاهای سالم به تسکین علایم التهاب روده کمک میکند. غذاهای کمفیبر، کمچرب و پرهیز از غذاهای تحریککننده، در درمان این بیماری موثرند.
تحقیقات نشان میدهند که التهاب مزمن روده ممکن است به دلیل حمله دستگاه ایمنی به خود بدن، بلکه به علت حمله به ویروسها و باکتریهای بیضرر یا غذای موجود در رودهها باشد.