فعالیتهای علامه جعفری در عرصه مبارزاتی تا اندازهای بارز بود که ساواک ایشان را تحت نظر داشت؛ سازمان اطلاعات و امنیت کشور چندین بار علامه جعفری را احضار کرد سؤالاتی را از وی در زمینه فعالیتهایش پرسید.
یک مولوی پژوه گفت: استاد علامه جعفری میگفتند من ۲۲۰۰ آیه در مثنوی کشف کردهام که مستقیم و غیر مستقیم به آن اشاره کرده و این حدوداً یک سوم قرآن است.
رهبر انقلاب گفتند: جایگاه ممتاز علمی و فکری هیچگاه مانع از فعالیتهای تبلیغی علامه جعفری و ارتباط ایشان با جوانان، دانشجویان، علما، اساتید و عموم مردم نشد.