نخستین مرکز بیوانفورماتیک کشاورزی ایران راه‌اندازی شد
مرکز بیوانفورماتیک کشاورزی با قابلیت آنالیز و ذخیره‌سازی حجم عظیمی از داده‌های کشاورزی در پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی راه‌اندازی شد.
به گزارش ایسنا، دکتر محمدرضا غفاری، رییس بخش بیولوژی سیستمهای پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی با اعلام این مطلب خاطرنشان کرد: با پیشرفتهای صورت گرفته در حوزه توالی یابی ژنوم و شناسایی پروتئین‌ها و متابولیت‌ها دانش بیولوژی سیستم‌ها و سنتتیک بیولوژی در حال دگردیسی کامل است به طوری که پیش بینی می شود گردش مالی آن در بازار جهانی از رقم چهار میلیارد دلار در سال 2015 به هشت میلیارد دلار در سال 2019 برسد. در این راستا پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی از سال 1394 با هدف همگام شدن با پیشرفتهای سریع این حوزه اقدام به توسعه سیستمهای نرم افزاری و سخت افزاری خود کرده که به راه اندازی مرکز بیوانفورماتیک کشاورزی (ABC) در پژوهشکده منجر شده است.
وی خاطرنشان کرد: این مرکز با برخورداری از دو سیستم سرور با 360 هسته و سه ترا بایت رم و همچنین 50 ترابایت فضای ذخیره فیزیکی مرکزی منحصر به فرد برای آنالیز داده های حجیم (BIG DATA ) کشاورزی در کشور است.
غفاری، برتری منطقه‌ای و بین‌المللی ایران در زمینه های مختلف آنالیزهای امیکس شامل داده‌های ژنومیکس، متابولومیکس، پروتومیکس، فنومیکس و بیوانفورماتیک، کمک به شناسایی ژنهای با ارزش اقتصادی بالا در کشاورزی، امکان ایجاد مرکز داده‌های متمرکز و کاهش هزینه های نرم افزاری و سخت افزاری بر پایه رایانش ابری را از جمله مزایا و دستاوردهای ایجاد مرکز عنوان و تصریح کرد: با راه اندازی مرکز بیوانفورماتیک کشاورزی امکان اجرای پروژه‌های بزرگ در حوزه زیست فناوری و کشاورزی که مستلزم تحلیل داده های عظیم است، فراهم شده است.
عضو هیات علمی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی خاطرنشان کرد: آنالیزهای داده‌های نسل جدید تعیین توالی یا NGS ها، آنالیزهای متاژنوم و مطالعات آنزیمی و مدل سازی این داده‌ها از زمینه‌های مهم تحقیقات زیست فناوری کشاورزی است که در مرکز بیوانفورماتیک کشاورزی انجام می شوند. از دیگر پروژه‌های این مرکز می‌توان به مطالعات در حوزه ژنومیکس شامل تعیین خلوص نژادی در اسبهای بومی ایران، طرح ثبت خط شناسه ژنتیکی در ماهیان، جمع آوری و ارزیابی ژرم پلاسما بومی گیاه شورپسند سالیکورنیا و سویدا، تولید آنزیمهای نوترکیب خوراک دام و طیور با استفاده از مطالعات در سطح متاژنوم و تغییر ساختار ریشه و تهیه اطلس از ژنهای کلیدی درگیر در افزایش تحمل به تنش خشکی جهت معرفی ارقام متحمل به خشکی در گیاهان استراتژیک نیز اشاره کرد.
وی در پایان با اشاره به برنامه ریزی صورت گرفته برای ارتقای ظرفیت سیستمهای مرکز بیوانفورماتیک کشاورزی به هزار هسته و هشت ترابایت رم و 500 ترابایت فضای ذخیره فیزیکی در آینده نزدیک ابراز امیدواری کرد با تامین منابع مالی لازم، امکان سرویس دهی مرکز به تمام مراکز تحقیقات کشاورزی کشور فراهم شود.
منبع: ایسنا
10
